Beberapa waktu lalu markas FSI sempat didatangi oleh sejumlah aparat kepolisian untuk diselidiki apakah forum ini memiliki keterkaitan terhadap milisi atau teroris . Diko Nugraha, Sekretaris Forum Syuhada Indonesia (FSI) merasa forum atau ormas Islam di Indonesia selalu dimonitori karena dianggap sebagai ancaman.